DESCRIPCIÓN

Omics Software Toolkit (omicSDK) es un kit de herramientas para la rápida creación y desarrollo de prototipos para el análisis de datos y visualización en ómicas y datos moleculares. Esta librería permite el filtrado, anotación y definición de relevancia clínica de datos ómicos, haciendo uso de pipelines estándar parametrizables, BBDD públicas, y un sistema propio de reglas según conocimiento experto. omicSDK permite realizar análisis genéticos, transcriptómicos, metabolómicos y proteómicos con mayor rapidez, eficiencia y precisión, combinando en un solo lugar distintas herramientas para realizar un análisis integral de los datos. Dentro de los prototipos realizados con esta herramienta, se encuentran tanto el desarrollo de una plataforma de priorización de variantes genómicas basados en el conocimiento experto, el desarrollo de una herramienta web para la comparación de perfiles genómicos para reproducción asistida, como una plataforma para el descubrimiento de eQTLs (“Expression quantitative trait loci”) en Esclerosis Múltiple.

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Bioinfo Club Octubre 2022: omicSDK: Librería para el procesamiento de datos ómicos

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