Journal Club 1: Enriquecimiento de microRNAs: Errores comunes y estrategias alternativas

BioinformaticsGRX vuelve con un Journal Club. ¿No sabes lo que es? Aquí te lo explicamos.

¿Qué es un Journal Club?

Journal Club es un concepto típico de los grupos de investigación, que consiste en cada cierto tiempo comentar algunos artículos que elige el ponente. La idea es explicar estos artículos y generar un debate abierto alrededor de estos.

Enriquecimiento de microRNAs: Errores comunes y estrategias alternativas

Los análisis de enriquecimiento de rutas a partir de listas de microRNAs empiezan a ser cada vez más utilizados. Sin embargo, existe mucha controversia en cuanto a los resultados que estos ofrecen, los cuales muestran un claro sesgo. Son muchos los grupos de investigación que intentan salvar este límite metodológico mediante la aplicación de variantes en el análisis. En los siguientes artículos se relacionan los inconvenientes del análisis clásico que enriquece por targets y se proponen distintas alternativas.

1. Patrice Godard, Jonathan van Eyll, Pathway analysis from lists of microRNAs: common pitfalls and alternative strategy, Nucleic Acids Research, Volume 43, Issue 7, 20 April 2015, Pages 3490–3497, https://doi.org/10.1093/nar/gkv249

2. Thomas Bleazard, Janine A Lamb, Sam Griffiths-Jones, Bias in microRNA functional enrichment analysis, Bioinformatics, Volume 31, Issue 10, 15 May 2015, Pages 1592–1598, https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv023

Ponente: Adrián García Moreno