DESCRIPCIÓN
BioinfoGRX, de la mano de Sara Herraiz Gil, presenta de forma breve una introducción a la herramienta web MetaboAnalyst 5.0, enfocada al análisis de datos metabolómicos.
En este minitutorial se seguirá el workflow característico/tradicional de análisis de datos metabolómicos:
1. Visualización y preprocesamiento de los datos: preprocesamiento (eliminación NA, etc) y normalización de los datos. Visualización de las muestras para detectar outliers (PCA y Heatmap).
2. Análisis diferencial de metabolitos (análisis estadísticos como t-test, fold-change, etc).
3. Interpretación funcional. Pathway análisis y KEGG database.
A continuación tenéis los enlaces a los recursos empleados durante el tutorial:
– MetaboAnalyst:
https://www.metaboanalyst.ca/
– Dataset:
https://www.metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST000002&StudyType=MS&ResultType=1
¡No dudeis en lanzar vuestras peguntas ante cualquier duda o curiosidad que os surja!
¡Esperamos que os guste!