DESCRIPCIÓN

 

La anotación funcional de genes es la identificación de las funciones en las que está implicado un gen. Es un procedimiento muy habitual que realizan los investigadores tras el cual obtienen largas listas de funciones, que suelen ser difíciles de interpretar. Así, en este trabajo se propone una herramienta que simplifica de forma personalizable las largas listas de anotación funcional de genes. Por lo tanto, el investigador/a puede elegir entre el método para calcular los valores de similitud entre las funciones para la simplificación mediante clustering, el tamaño deseado de la nueva lista simplificada de funciones o si agregar o no un término de interés y ver la proximidad entre el nuevo término con la lista de funciones. El resultado final es la obtención de una lista simplificada en un archivo Excel. Algunas mejoras quedan aún por hacer, como por ejemplo eliminar funciones comunes que no aporten información adicional en el estudio.

 

Ponente

BioinfoClub Marzo 2022: Simplificación de listas de anotación funcional

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