DESCRIPCIÓN La Gene Ontology (GO) permitió estandarizar los términos usados para describir los productos génicos funcionalmente. El uso de las anotaciones GO en análisis bioinformático ha sido habitual y creciente en los últimos 20 años. El escenario actual y futuro
Bioinfo Club Abril 2022: Demographic inference using a MCMC-coupled Generative Adversarial Network
DESCRIPCIÓN Recently, various deep learning approaches have yielded highly promising results in demographic inference. One of these — Generative Adversarial Networks (GANs) — is particularly useful for mimicking real data while exploring the joint probability distribution of parameters that
BioinfoClub Marzo 2022: Simplificación de listas de anotación funcional
DESCRIPCIÓN La anotación funcional de genes es la identificación de las funciones en las que está implicado un gen. Es un procedimiento muy habitual que realizan los investigadores tras el cual obtienen largas listas de funciones, que suelen ser
Bioinfo Club Febrero 2022: Deciphering the cellular, molecular, clinical and therapeutic implications of lung cancers lacking targeted therapies
DESCRIPCIÓN Lung cancer remains the most common cancer worldwide, both in terms of incidence and mortality. Lung cancer is classified in two broad histologic classes, which grow and spread differently: small-cell lung carcinomas (SCLC) and non-small cell lung carcinomas (NSCLC).
BioinfoClub Enero 2022: Caracterización de redes de señalización a partir de transcriptoma de pacientes pediátricos con Leucemia Mieloide Aguda y reposicionamiento de fármacos.
DESCRIPCIÓN La Leucemia Mieloide Aguda (AML) es un tipo de leucemia muy heterogénea y, aunque es poco prevalente en pacientes pediátricos, su mortalidad sigue siendo elevada. Existen varias alteraciones genéticas asociadas a esta enfermedad y cada una se asocia a
Bioinfo Club Diciembre 2021: From Information Theory to Systems Biology: High Entropy Genes (and their application to HCC)
DESCRIPCIÓN In this work, I will present SparseGMM, a method for gene regulatory network learning and inference, which is novel in its ability to combine co-expression patterns with a graph-based Bayesian framework to infer the complex molecular structure of cancer