La Gene Ontology (GO) permitió estandarizar los términos usados para describir los productos génicos funcionalmente. El uso de las anotaciones GO en análisis bioinformático ha sido habitual y creciente en los últimos 20 años. El escenario actual y futuro requiere que las máquinas sean capaces de procesar correctamente el significado biológico de estas anotaciones, tanto para su uso efectivo por parte de algoritmos de aprendizaje automático, como para la formulación y comprobación computacional de hipótesis de investigación. En los últimos años desde el consorcio GO se ha propuesto una evolución de las anotaciones GO que cubran algunas limitaciones de las anotaciones originales. En esta presentación describiremos trabajo realizado en el consorcio GREEKC, que pretende estandarizar la representación computacional de la información y conocimiento en el campo de la regulación génica, mostrando ejemplos de las limitaciones de la representación tradicional y las vías para su mejora.
Material suplementario:
https://doi.org/10.1016/j.bbagrm.2021.194766
https://github.com/jesualdotomasfernandezbreis/greekc
https://github.com/GREEKC/GRAO