Descripción
BioInfoGRX (RSG Spain Granada) presenta la mesa redonda anual, para la cual traemos tres perfiles bioinformáticos que nos contarán su experiencia profesional y debatirán sobre las diferencias entre el sector público y privado en el mundo de la bioinformática, además de responder las preguntas de la audiencia.
Ponentes
Dra. Ana Conesa – Jefa de Grupo en genómica de expresión de genes. Profesora investigadora en el CSIC.
Profesora Investigadora del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y profesora de cortesía en la Universidad de Florida. En enero de 2022, fue elegida como Miembro de la Real Academia Española de Ingeniería.
Su investigación se centra en comprender los aspectos funcionales de la expresión génica, a nivel de todo el genoma, en diferentes organismos y en relación con los procesos patológicos. Su grupo ha desarrollado y liderado la creación de software bioinformático muy popular como Blast2GO, Paintomics, maSigPro, NOISeq, Qualimap, SQANTI o tappAS, que tod@s hemos usado o usaremos en algún momento. Ha publicado más de 144 artículos de investigación que han recibido más de 29.000 citas y cuenta con un índice h de 53. Su investigación tiene financiación nacional e internacional, incluyendo H2020, Becas Marie Curie, NIH, NASA y USDA, así como fundaciones privadas como Santander, JDRF y Helmsley. Dirige varios proyectos en consorcios de la UE y los EE.UU. Entre ellos, el proyecto STATegra (11 socios) sobre la integración de datos multiómicos y la beca Marie Curie DEANN para crear una red NGS con países americanos (16 socios) y dirige un equipo de 6 IPs en la Universidad de Florida para desarrollar modelos multiómicos para la progresión de la Diabetes Tipo 1. Su labor divulgadora le ha llevado a organizar numerosas conferencias sobre bioinformática y NGS -incluyendo la mayor conferencia en el campo de la Biología Computacional ISMB- e imparte cursos especializados de bioinformática en más de 10 países en 5 continentes.
Es cofundadora y asesora científico de Biobam Bioinformatics, una empresa que opera desde 2010 para crear soluciones bioinformáticas para biólogos.
Dr. Pablo Minguez – Investigador Miguel Servet en el Departamento de Genética y Genómica y Jefe de Unidad de Bioinformática del Instituto de Investigación Sanitaria Fundación Jiménez Díaz (IIS-FJD).
Biólogo por la Universidad de Alcalá, en 2002 hizo un Máster en Bioinformática en la Universidad de East Anglia. Realizó su tesis doctoral en el grupo de Joaquín Dopazo en el CIPF en Valencia desarrollando métodos para la caracterización funcional de experimentos ómicos. Después hizo una estancia postdoctoral del 2009 al 2014 en el EMBL en Heidelberg en el grupo de Peer Bork donde estudió la regulación postraduccional de proteínas y de las funciones de los diferentes tipos de modificaciones. Actualmente es investigador principal de varios proyectos en el Departamento de Genética y Genómica de la Fundación Jiménez Díaz en Madrid que dirige Carmen Ayuso, donde se centra en el estudio de las enfermedades genéticas y raras creando recursos y algoritmos para la priorización de variantes patogénicas o la predicción de nuevas asociaciones gen-enfermedad. También es coordinador de la Unidad de Bioinformática del mismo Instituto. A lo largo de su carrera ha estado implicado en el equipo de desarrollo de varios recursos bioinformáticos como Babelomics, STRING o PTMcode. Entre sus actividades en red, participa en los grupos de bioinformática del CIBERER, en la red TransBioNet, en el proyecto IMPACT-Genómica e IMPACT-Data, la red RAREGenomics, y co-organiza el congreso BioinfoCAM. Ha publicado 63 artículos científicos, tiene un índice h de 27 y mas de 10000 citas. Recientemente ha sido nombrado académico correspondiente en la Real Academia Nacional de Medicina.
Dr. Dietmar Fernández – Empresa privada (CERBA). Responsable del área de biología molecular/bioinformática.
Dietmar Fernandez se licenció en Biología en la Universidad del País Vasco (UPV/EHU) en 2003. En unas prácticas de Bioinformática de la carrera, se interesó en este campo y se decidió por realizar el Master de Bioinformatica y Biología Computacional organizado por la Universidad Complutense de Madrid. Las prácticas del Master las realizó en la empresa Progenika Biopharma, donde al finalizar obtuvo una beca predoctoral y realizó el doctorado en Bioinformatica en colaboración con la UPV/EHU. En 2010, obtuvo el titulo de doctor Cum Laude en 2010 con la tesis titulada “Marcadores diagnósticos y terapéuticos en esquizofrenia y trastorno bipolar mediante microarrays de ADN: un estudio en cerebro humano postmortem” y paso a formar parte de la unidad de Genomica Funcional de Progenika Biopharma proporcionando servicios de Bioinformatica basados en análisis de microarrays y posteriormente de NGS. En 2013 comenzó como Investigador Post doctoral en el departamento de Microbiología del Hospital Clinic, llevando a cabo toda la parte de análisis de NGS del departamento. Tras la finalización del proyecto, continuo como Técnico en Bioinformática en el Instituto de Salud Global de Barcelona (ISGlobal). Posteriormente, en 2019 reanudó su experiencia post doctoral en el European Genome Phenome Archive (EGA) situado en el Centro de Regulación Genómica (CRG). En 2021 pasó a formar parte de Cerba Internacional, un laboratorio de análisis clínicos como responsable de Biología Molecular y Bioinformatica donde continua en la actualidad. Cuenta con más de 15 articulos publicados en revistas científicas entre las que hay Nature Communications, Briefings in Bioinformatics y Nucleic Acids Research entre otras.